Augustin lit le Psaume 78 comme un avertissement adressé à l'Église : le peuple de Dieu doit se souvenir de ses bienfaits, accueillir sa parole avec humilité et éviter l'incrédulité et l'ingratitude qui ont attiré le jugement sur Israël. Les paraboles et les énigmes du psaume appellent une interprétation intérieure. L'Exode devient une suite de figures accomplies dans le Christ : le rocher signifie le Christ, la traversée de la mer le Baptême, la nuée et le feu la conduite divine, et la manne le Pain du Ciel communiqué par le Christ et l'Évangile. Les plaies sont interprétées allégoriquement comme les signes des vices et de la servitude spirituelle, les dix plaies correspondant aux commandements. Les récriminations d'Israël au désert révèlent une foi en quête d'avantages terrestres plutôt que de Dieu lui-même, tandis que les « fils d'Éphraïm » représentent une observance purement extérieure privée de la grâce de l'Esprit. Augustin voit dans la Terre promise, la montagne de Sion, David et le troupeau du pasteur des figures de l'Église et du Christ, dont l'héritage s'étend aux nations païennes. L'Église est fondée pour demeurer à jamais, et les croyants sont guidés par l'innocence du cœur du Christ et la prudence de ses mains.